募捐权限：公募基金会能向公众募捐，非公募基金会只能接受特定组织或个人捐赠。

资金稳定性：公募基金会资金来源广但波动大，非公募基金会资金来源集中且更稳定。信息披露：公募基金会披露要求严格，需定期向公众详细公开信息；非公募基金会主要向捐赠者和监管部门报告，要求稍低。运作方式：非公募基金会项目运作自主性强，公募基金会则要遵循更严格流程，灵活性受限。设立条件：公募基金会原始基金要求更高，组织架构等方面规定更严，非公募基金会门槛相对较低 。